316 पेपर
यह शोध पत्र प्रोजेक्ट-विशिष्ट प्रयोगात्मक डेटा का उपयोग करके Boltz-2 को फाइन-ट्यून करने के लिए एक ओपन फ्रेमवर्क पेश करता है, जो लीड ऑप्टिमाइज़ेशन के लिए इसकी प्रोटीन-लिगैंड बाइंडिंग एफिनिटी भविष्यवाणी क्षमताओं को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ाता है, और फ्री एनर्जी परटर्बेशन विधियों के प्रतिस्पर्धी प्रदर्शन को प्राप्त करता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एक इन विट्रो-पुनर्गठित (in vitro-reconstituted) ड्रोसोफिला Arc1 कैप्सिड, जिसे स्तनधारी रिसेप्टर SORCS2 से जुड़ने के लिए इंजीनियर किया गया है, mdx चूहों की डिस्ट्रोफिक मांसपेशियों तक Cas9 जीन एडिटर्स को कुशलतापूर्वक पहुँचाता है, जिससे महत्वपूर्ण एक्सॉन स्किपिंग और डिस्ट्रोफिन अभिव्यक्ति की बहाली प्राप्त होती है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि केवल CTCF अधिभोग (occupancy) के बजाय, कोहेसिन-मध्यस्थता वाले लूप एक्सट्रूज़न टकराव (cohesin-mediated loop extrusion collisions), CTCF साइटों और ट्रांसक्रिप्शन स्टार्ट साइटों पर व्यवस्थित न्यूक्लियोसोम आर्किटेक्चर को सक्रिय रूप से बनाए रखते हैं।
यह अध्ययन डीप लर्निंग का उपयोग करके एक नवीन चक्रीय (cyclic) MC4R एगोनिस्ट को डिजाइन, अनुकूलित और मान्य करने के माध्यम से, जो उच्च क्षमता प्राप्त करता है और चूहों में भोजन के सेवन को काफी कम कर देता है, डी नोवो पेप्टाइड ड्रग डिस्कवरी के लिए एक सामान्यीकरण योग्य एंड-टू-एंड वर्कफ़्लो स्थापित करता है।
MAP3K7 इंट्रॉन के हाई-थ्रूपुट म्यूटैजेनेसिस और SHAPE-MAP विश्लेषण के माध्यम से, यह अध्ययन प्रकट करता है कि जबकि SF3B1 उत्परिवर्तनों के संदर्भ में ब्रांचपॉइंट उत्परिवर्तन क्रिप्टिक स्प्लिस-साइट सक्रियण के प्राथमिक चालक हैं, सटीक स्प्लिसिंग एक एकल संरक्षित संरचना के बजाय व्यापक RNA संरचनात्मक परिवर्तनशीलता द्वारा बनाए रखी जाती है, सिवाय विशिष्ट RNA-बाइंडिंग प्रोटीन हॉटस्पॉट्स के जहाँ संरचनात्मक समानता स्प्लिसिंग परिणामों के साथ सह-संबंधित होती है।
यह शोधपत्र Easymode को प्रस्तुत करता है, जो 4,000 से अधिक टिल्ट सीरीज़ पर प्रशिक्षित प्रीट्रेंड जनरल सेगमेंटेशन नेटवर्क्स की एक लाइब्रेरी है, जो सेलुलर क्रायो-ईटी (cryo-ET) में मैक्रोमोलेक्यूल्स को पहचानने, निकालने और उनका विश्लेषण करने के लिए लचीले, प्रशिक्षण-मुक्त वर्कफ़्लो को सक्षम बनाता है, जिसे IMPDH फिलामेंट्स की 4.0 Å इन सीटू संरचना निर्धारित करने और उनके सेलुलर वातावरण को मैप करने द्वारा प्रदर्शित किया गया है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मानव लिम्फोसाइट्स में कम खुराक वाले विकिरण-प्रेरित अनुकूल प्रतिक्रिया (adaptive response) समय-निर्भर और कोशिका-प्रकार-विशिष्ट तरीके से प्रारंभिक डीएनए डबल-स्ट्रैंड ब्रेक सिग्नलिंग (γH2AX फोकी द्वारा मापा गया) को महत्वपूर्ण रूप से कम करती है, जिसमें अधिकतम सुरक्षा प्राइमिंग के 15 घंटे बाद होती है।
यह शोध पत्र एक सामान्यीकृत माइक्रोफ्लुइडिक रणनीति प्रस्तुत करता है जो एफिनिटी टैग्स का उपयोग करके न्यूनतम लाइसेट या इन विट्रो ट्रांसलेशन वॉल्यूम से सीधे प्रोटीन को कैप्चर और फोटो-एल्यूट (photo-elute) करती है, जिससे पारंपरिक वर्कफ़्लो की तुलना में नमूना खपत और तैयारी के समय में भारी कमी लाते हुए उच्च-रिज़ॉल्यूशन क्रायो-ईएम (Cryo-EM) संरचना निर्धारण सक्षम होता है।
यह अध्ययन एक अनुकूलित PhoX क्रॉस-लिंकिंग मास स्पेक्ट्रोमेट्री वर्कफ़्लो के माध्यम से उत्पन्न *Arabidopsis thaliana* के लिए एक बड़े पैमाने पर संरचनात्मक प्रोटिओमिक्स संसाधन प्रस्तुत करता है, जिसने 52,000 से अधिक क्रॉस-लिंक्ड पेप्टाइड युग्मों की पहचान की जो हजारों प्रोटीन-प्रोटीन इंटरैक्शन को परिभाषित करते हैं और फोटोसिस्टम, राइबोसोम तथा हिस्टोन कॉम्प्लेक्स जैसे विविध आणविक मशीनों के लिए अवशेष-स्तर (residue-level) के स्थानिक प्रतिबंध प्रदान करते हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि म्यूरिन ल्यूपस (murine lupus) में, थोरैसिक एओर्टिक पेरिवस्कुलर एडिपोज टिश्यू इंटरफेरॉन-संचालित सूजन, माइटोकॉन्ड्रियल बायोएनेर्जेटिक विफलता और अधिग्रहित एडिपोजेनिक प्रोजेनिटर विभेदन की हानि द्वारा लक्षित एक समन्वित आणविक पुनर्गठन से गुजरता है, जो सामूहिक रूप से ल्यूपस-संबंधित वैस्कुलोपैथी को प्रेरित करता है।